Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TchpQ3TVW5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TchpQ3TVW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TchpQ3TVW5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TchpQ3TVW5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TchpQ3TVW5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TchpQ3TVW5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TchpQ3TVW5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TchpQ3TVW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TchpQ3TVW5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TchpQ3TVW5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TchpQ3TVW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TchpQ3TVW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TchpQ3TVW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TchpQ3TVW5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms