Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gtf3c3Q3TMP1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf3c3Q3TMP1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gtf3c3Q3TMP1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gtf3c3Q3TMP1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf3c3Q3TMP1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf3c3Q3TMP1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf3c3Q3TMP1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf3c3Q3TMP1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gtf3c3Q3TMP1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gtf3c3Q3TMP1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms