Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim43aQ3TL54 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim43aQ3TL54 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim43aQ3TL54 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim43aQ3TL54 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim43aQ3TL54 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim43aQ3TL54 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim43aQ3TL54 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim43aQ3TL54 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim43aQ3TL54 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim43aQ3TL54 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim43aQ3TL54 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim43aQ3TL54 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim43aQ3TL54 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim43aQ3TL54 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim43aQ3TL54 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim43aQ3TL54 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim43aQ3TL54 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim43aQ3TL54 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim43aQ3TL54 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim43aQ3TL54 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim43aQ3TL54 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms