Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDK6

Rogdi, Protein rogdi homolog, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RogdiQ3TDK6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RogdiQ3TDK6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RogdiQ3TDK6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RogdiQ3TDK6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RogdiQ3TDK6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RogdiQ3TDK6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RogdiQ3TDK6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms