Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Patl1Q3TC46 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Patl1Q3TC46 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Patl1Q3TC46 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl1Q3TC46 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Patl1Q3TC46 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Patl1Q3TC46 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms