Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA6

Helq, Helicase POLQ-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelqQ2VPA6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HelqQ2VPA6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HelqQ2VPA6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
HelqQ2VPA6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HelqQ2VPA6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HelqQ2VPA6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelqQ2VPA6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelqQ2VPA6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelqQ2VPA6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HelqQ2VPA6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HelqQ2VPA6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HelqQ2VPA6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HelqQ2VPA6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HelqQ2VPA6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HelqQ2VPA6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HelqQ2VPA6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HelqQ2VPA6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HelqQ2VPA6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HelqQ2VPA6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HelqQ2VPA6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HelqQ2VPA6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HelqQ2VPA6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HelqQ2VPA6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HelqQ2VPA6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms