Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam47cQ14BE7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam47cQ14BE7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam47cQ14BE7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam47cQ14BE7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam47cQ14BE7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam47cQ14BE7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam47cQ14BE7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam47cQ14BE7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam47cQ14BE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam47cQ14BE7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam47cQ14BE7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam47cQ14BE7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam47cQ14BE7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam47cQ14BE7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam47cQ14BE7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam47cQ14BE7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam47cQ14BE7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam47cQ14BE7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam47cQ14BE7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam47cQ14BE7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam47cQ14BE7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms