Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ppp4r2Q0VGB7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ppp4r2Q0VGB7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ppp4r2Q0VGB7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ppp4r2Q0VGB7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ppp4r2Q0VGB7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ppp4r2Q0VGB7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Ppp4r2Q0VGB7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ppp4r2Q0VGB7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ppp4r2Q0VGB7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ppp4r2Q0VGB7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ppp4r2Q0VGB7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ppp4r2Q0VGB7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ppp4r2Q0VGB7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ppp4r2Q0VGB7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ppp4r2Q0VGB7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ppp4r2Q0VGB7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ppp4r2Q0VGB7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ppp4r2Q0VGB7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ppp4r2Q0VGB7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ppp4r2Q0VGB7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ppp4r2Q0VGB7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ppp4r2Q0VGB7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ppp4r2Q0VGB7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ppp4r2Q0VGB7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ppp4r2Q0VGB7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ppp4r2Q0VGB7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ppp4r2Q0VGB7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ppp4r2Q0VGB7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ppp4r2Q0VGB7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ppp4r2Q0VGB7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ppp4r2Q0VGB7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ppp4r2Q0VGB7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppp4r2Q0VGB7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ppp4r2Q0VGB7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms