Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smim24Q0VG18 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smim24Q0VG18 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smim24Q0VG18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim24Q0VG18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim24Q0VG18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms