Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms