Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox13Q04891 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox13Q04891 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox13Q04891 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox13Q04891 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox13Q04891 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox13Q04891 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox13Q04891 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox13Q04891 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox13Q04891 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox13Q04891 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox13Q04891 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox13Q04891 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox13Q04891 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox13Q04891 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox13Q04891 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox13Q04891 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox13Q04891 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox13Q04891 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox13Q04891 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms