Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnb1Q03717 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kcnb1Q03717 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kcnb1Q03717 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kcnb1Q03717 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kcnb1Q03717 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kcnb1Q03717 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kcnb1Q03717 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kcnb1Q03717 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kcnb1Q03717 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kcnb1Q03717 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kcnb1Q03717 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kcnb1Q03717 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kcnb1Q03717 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kcnb1Q03717 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kcnb1Q03717 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Kcnb1Q03717 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kcnb1Q03717 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnb1Q03717 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcnb1Q03717 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kcnb1Q03717 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kcnb1Q03717 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnb1Q03717 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcnb1Q03717 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnb1Q03717 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnb1Q03717 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms