Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
F8a1Q00558 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8a1Q00558 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8a1Q00558 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8a1Q00558 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8a1Q00558 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8a1Q00558 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms