Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lig3P97386 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lig3P97386 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lig3P97386 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lig3P97386 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lig3P97386 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lig3P97386 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lig3P97386 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lig3P97386 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lig3P97386 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lig3P97386 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lig3P97386 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lig3P97386 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lig3P97386 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lig3P97386 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lig3P97386 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig3P97386 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lig3P97386 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lig3P97386 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lig3P97386 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lig3P97386 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lig3P97386 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lig3P97386 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lig3P97386 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lig3P97386 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lig3P97386 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lig3P97386 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lig3P97386 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lig3P97386 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lig3P97386 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lig3P97386 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lig3P97386 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lig3P97386 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lig3P97386 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lig3P97386 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig3P97386 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms