Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msx3P70354 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Msx3P70354 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msx3P70354 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msx3P70354 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msx3P70354 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msx3P70354 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msx3P70354 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msx3P70354 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msx3P70354 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msx3P70354 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msx3P70354 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Msx3P70354 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Msx3P70354 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msx3P70354 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msx3P70354 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msx3P70354 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msx3P70354 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msx3P70354 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msx3P70354 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Msx3P70354 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msx3P70354 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msx3P70354 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Msx3P70354 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Msx3P70354 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Msx3P70354 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Msx3P70354 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms