Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps28P62858 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps28P62858 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps28P62858 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps28P62858 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps28P62858 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps28P62858 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps28P62858 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps28P62858 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rps28P62858 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps28P62858 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps28P62858 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps28P62858 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms