Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d1P61080 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2d1P61080 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d1P61080 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d1P61080 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms