Protein–RNA interactions for Protein: P59281

Arhgap39, Rho GTPase-activating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap39P59281 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap39P59281 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap39P59281 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap39P59281 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap39P59281 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgap39P59281 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap39P59281 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap39P59281 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap39P59281 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap39P59281 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap39P59281 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arhgap39P59281 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arhgap39P59281 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap39P59281 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap39P59281 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap39P59281 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap39P59281 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap39P59281 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap39P59281 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms