Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Csrnp3P59055 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Csrnp3P59055 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Csrnp3P59055 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Csrnp3P59055 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Csrnp3P59055 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Csrnp3P59055 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Csrnp3P59055 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Csrnp3P59055 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Csrnp3P59055 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Csrnp3P59055 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Csrnp3P59055 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Csrnp3P59055 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Csrnp3P59055 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Csrnp3P59055 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Csrnp3P59055 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Csrnp3P59055 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Csrnp3P59055 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Csrnp3P59055 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Csrnp3P59055 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Csrnp3P59055 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Csrnp3P59055 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Csrnp3P59055 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Csrnp3P59055 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Csrnp3P59055 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Csrnp3P59055 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms