Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Samsn1P57725 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Samsn1P57725 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samsn1P57725 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samsn1P57725 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Samsn1P57725 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samsn1P57725 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samsn1P57725 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samsn1P57725 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samsn1P57725 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Samsn1P57725 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samsn1P57725 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samsn1P57725 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Samsn1P57725 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samsn1P57725 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Samsn1P57725 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Samsn1P57725 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samsn1P57725 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samsn1P57725 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samsn1P57725 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samsn1P57725 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samsn1P57725 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samsn1P57725 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samsn1P57725 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Samsn1P57725 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Samsn1P57725 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Samsn1P57725 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Samsn1P57725 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Samsn1P57725 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Samsn1P57725 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Samsn1P57725 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Samsn1P57725 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samsn1P57725 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Samsn1P57725 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms