Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd38P56528 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd38P56528 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd38P56528 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd38P56528 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd38P56528 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd38P56528 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd38P56528 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd38P56528 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd38P56528 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd38P56528 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd38P56528 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd38P56528 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd38P56528 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd38P56528 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd38P56528 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd38P56528 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd38P56528 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd38P56528 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd38P56528 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd38P56528 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd38P56528 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd38P56528 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd38P56528 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd38P56528 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd38P56528 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd38P56528 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd38P56528 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd38P56528 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd38P56528 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd38P56528 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd38P56528 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd38P56528 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd38P56528 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd38P56528 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms