Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defb1P56386 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb1P56386 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb1P56386 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defb1P56386 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defb1P56386 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms