Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdh5P55284 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh5P55284 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh5P55284 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh5P55284 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh5P55284 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh5P55284 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh5P55284 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh5P55284 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh5P55284 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh5P55284 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh5P55284 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh5P55284 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdh5P55284 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms