Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CebpaP53566 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CebpaP53566 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CebpaP53566 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CebpaP53566 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CebpaP53566 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CebpaP53566 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CebpaP53566 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CebpaP53566 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CebpaP53566 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CebpaP53566 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CebpaP53566 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CebpaP53566 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CebpaP53566 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CebpaP53566 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CebpaP53566 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CebpaP53566 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CebpaP53566 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CebpaP53566 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CebpaP53566 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CebpaP53566 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CebpaP53566 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CebpaP53566 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CebpaP53566 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CebpaP53566 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CebpaP53566 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CebpaP53566 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CebpaP53566 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CebpaP53566 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CebpaP53566 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CebpaP53566 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CebpaP53566 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CebpaP53566 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CebpaP53566 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CebpaP53566 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CebpaP53566 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CebpaP53566 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CebpaP53566 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.1 ms