Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa13P50711 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa13P50711 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa13P50711 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa13P50711 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa13P50711 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa13P50711 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa13P50711 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa13P50711 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa13P50711 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa13P50711 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa13P50711 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms