Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptx3P48759 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptx3P48759 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptx3P48759 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptx3P48759 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptx3P48759 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptx3P48759 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptx3P48759 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptx3P48759 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptx3P48759 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptx3P48759 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptx3P48759 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptx3P48759 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptx3P48759 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptx3P48759 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptx3P48759 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptx3P48759 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptx3P48759 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptx3P48759 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptx3P48759 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptx3P48759 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptx3P48759 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms