Protein–RNA interactions for Protein: P47993

Xcl1, Lymphotactin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xcl1P47993 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xcl1P47993 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xcl1P47993 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xcl1P47993 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xcl1P47993 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xcl1P47993 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xcl1P47993 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xcl1P47993 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xcl1P47993 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xcl1P47993 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xcl1P47993 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xcl1P47993 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xcl1P47993 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xcl1P47993 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xcl1P47993 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xcl1P47993 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xcl1P47993 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms