Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tac1P41539 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tac1P41539 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tac1P41539 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tac1P41539 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tac1P41539 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tac1P41539 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tac1P41539 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tac1P41539 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tac1P41539 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tac1P41539 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tac1P41539 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tac1P41539 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tac1P41539 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tac1P41539 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tac1P41539 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tac1P41539 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tac1P41539 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tac1P41539 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tac1P41539 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tac1P41539 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tac1P41539 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tac1P41539 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tac1P41539 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tac1P41539 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tac1P41539 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tac1P41539 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tac1P41539 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tac1P41539 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tac1P41539 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms