Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RetP35546 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RetP35546 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RetP35546 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RetP35546 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RetP35546 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RetP35546 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RetP35546 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RetP35546 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RetP35546 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RetP35546 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RetP35546 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RetP35546 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RetP35546 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RetP35546 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RetP35546 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RetP35546 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RetP35546 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RetP35546 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RetP35546 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RetP35546 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RetP35546 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RetP35546 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RetP35546 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RetP35546 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RetP35546 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RetP35546 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RetP35546 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RetP35546 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RetP35546 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RetP35546 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RetP35546 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RetP35546 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RetP35546 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RetP35546 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RetP35546 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RetP35546 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RetP35546 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RetP35546 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RetP35546 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RetP35546 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RetP35546 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RetP35546 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RetP35546 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RetP35546 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RetP35546 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RetP35546 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RetP35546 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RetP35546 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RetP35546 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RetP35546 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RetP35546 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RetP35546 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RetP35546 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RetP35546 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RetP35546 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RetP35546 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RetP35546 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RetP35546 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RetP35546 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RetP35546 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RetP35546 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RetP35546 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RetP35546 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RetP35546 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RetP35546 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RetP35546 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RetP35546 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RetP35546 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RetP35546 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RetP35546 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RetP35546 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RetP35546 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RetP35546 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RetP35546 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RetP35546 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RetP35546 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RetP35546 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RetP35546 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RetP35546 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RetP35546 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RetP35546 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RetP35546 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RetP35546 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RetP35546 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RetP35546 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RetP35546 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RetP35546 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RetP35546 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RetP35546 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RetP35546 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RetP35546 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RetP35546 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RetP35546 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RetP35546 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RetP35546 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RetP35546 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RetP35546 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RetP35546 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RetP35546 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms