Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KrasP32883 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KrasP32883 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KrasP32883 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KrasP32883 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KrasP32883 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KrasP32883 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KrasP32883 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KrasP32883 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KrasP32883 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KrasP32883 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KrasP32883 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KrasP32883 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KrasP32883 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KrasP32883 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KrasP32883 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KrasP32883 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KrasP32883 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KrasP32883 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KrasP32883 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KrasP32883 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KrasP32883 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KrasP32883 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KrasP32883 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KrasP32883 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KrasP32883 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KrasP32883 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KrasP32883 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KrasP32883 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KrasP32883 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KrasP32883 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KrasP32883 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KrasP32883 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KrasP32883 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KrasP32883 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KrasP32883 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KrasP32883 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KrasP32883 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KrasP32883 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KrasP32883 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KrasP32883 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KrasP32883 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KrasP32883 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KrasP32883 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KrasP32883 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KrasP32883 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KrasP32883 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KrasP32883 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KrasP32883 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KrasP32883 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KrasP32883 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KrasP32883 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KrasP32883 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KrasP32883 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KrasP32883 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KrasP32883 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KrasP32883 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KrasP32883 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KrasP32883 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KrasP32883 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KrasP32883 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KrasP32883 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KrasP32883 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KrasP32883 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KrasP32883 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KrasP32883 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KrasP32883 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KrasP32883 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KrasP32883 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KrasP32883 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KrasP32883 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KrasP32883 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KrasP32883 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KrasP32883 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KrasP32883 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KrasP32883 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KrasP32883 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KrasP32883 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KrasP32883 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KrasP32883 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KrasP32883 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KrasP32883 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KrasP32883 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KrasP32883 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KrasP32883 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KrasP32883 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KrasP32883 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KrasP32883 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KrasP32883 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KrasP32883 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KrasP32883 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KrasP32883 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KrasP32883 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KrasP32883 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KrasP32883 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KrasP32883 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KrasP32883 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KrasP32883 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KrasP32883 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KrasP32883 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms