Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kif3aP28741 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kif3aP28741 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kif3aP28741 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kif3aP28741 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kif3aP28741 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kif3aP28741 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif3aP28741 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif3aP28741 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kif3aP28741 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kif3aP28741 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kif3aP28741 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kif3aP28741 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kif3aP28741 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kif3aP28741 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kif3aP28741 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kif3aP28741 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kif3aP28741 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kif3aP28741 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kif3aP28741 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kif3aP28741 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kif3aP28741 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif3aP28741 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kif3aP28741 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kif3aP28741 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kif3aP28741 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kif3aP28741 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif3aP28741 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms