Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap1P28660 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap1P28660 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nckap1P28660 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nckap1P28660 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap1P28660 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nckap1P28660 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nckap1P28660 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms