Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BgnP28653 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BgnP28653 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BgnP28653 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BgnP28653 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BgnP28653 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BgnP28653 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BgnP28653 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BgnP28653 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BgnP28653 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BgnP28653 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BgnP28653 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BgnP28653 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BgnP28653 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BgnP28653 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BgnP28653 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BgnP28653 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BgnP28653 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BgnP28653 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BgnP28653 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BgnP28653 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BgnP28653 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BgnP28653 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BgnP28653 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BgnP28653 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BgnP28653 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BgnP28653 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BgnP28653 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BgnP28653 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BgnP28653 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BgnP28653 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BgnP28653 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BgnP28653 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BgnP28653 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BgnP28653 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BgnP28653 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BgnP28653 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BgnP28653 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BgnP28653 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BgnP28653 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BgnP28653 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BgnP28653 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BgnP28653 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BgnP28653 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BgnP28653 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BgnP28653 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BgnP28653 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BgnP28653 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BgnP28653 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BgnP28653 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BgnP28653 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BgnP28653 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BgnP28653 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BgnP28653 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BgnP28653 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BgnP28653 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BgnP28653 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BgnP28653 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BgnP28653 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BgnP28653 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BgnP28653 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BgnP28653 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BgnP28653 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BgnP28653 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BgnP28653 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BgnP28653 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BgnP28653 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BgnP28653 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BgnP28653 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BgnP28653 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BgnP28653 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BgnP28653 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BgnP28653 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BgnP28653 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BgnP28653 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BgnP28653 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BgnP28653 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BgnP28653 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BgnP28653 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BgnP28653 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BgnP28653 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BgnP28653 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BgnP28653 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BgnP28653 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BgnP28653 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BgnP28653 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BgnP28653 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BgnP28653 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BgnP28653 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BgnP28653 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BgnP28653 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BgnP28653 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BgnP28653 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BgnP28653 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BgnP28653 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BgnP28653 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BgnP28653 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BgnP28653 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BgnP28653 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BgnP28653 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms