Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc6a9P28571 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc6a9P28571 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc6a9P28571 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc6a9P28571 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc6a9P28571 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc6a9P28571 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc6a9P28571 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc6a9P28571 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc6a9P28571 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc6a9P28571 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc6a9P28571 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc6a9P28571 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc6a9P28571 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms