Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpbP27048 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpbP27048 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpbP27048 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpbP27048 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpbP27048 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpbP27048 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpbP27048 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpbP27048 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpbP27048 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpbP27048 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpbP27048 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpbP27048 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpbP27048 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpbP27048 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpbP27048 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpbP27048 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpbP27048 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpbP27048 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpbP27048 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpbP27048 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpbP27048 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpbP27048 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpbP27048 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SnrpbP27048 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpbP27048 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpbP27048 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpbP27048 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpbP27048 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpbP27048 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpbP27048 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms