Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ChgaP26339 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ChgaP26339 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ChgaP26339 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ChgaP26339 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ChgaP26339 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms