Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnna1P26231 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctnna1P26231 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnna1P26231 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnna1P26231 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnna1P26231 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnna1P26231 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnna1P26231 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnna1P26231 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnna1P26231 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnna1P26231 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnna1P26231 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctnna1P26231 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctnna1P26231 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctnna1P26231 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctnna1P26231 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctnna1P26231 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctnna1P26231 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnna1P26231 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnna1P26231 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ctnna1P26231 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctnna1P26231 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms