Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BdnfP21237 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BdnfP21237 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BdnfP21237 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BdnfP21237 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BdnfP21237 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BdnfP21237 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BdnfP21237 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BdnfP21237 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BdnfP21237 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BdnfP21237 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BdnfP21237 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BdnfP21237 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BdnfP21237 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BdnfP21237 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BdnfP21237 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BdnfP21237 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BdnfP21237 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BdnfP21237 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BdnfP21237 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BdnfP21237 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BdnfP21237 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BdnfP21237 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BdnfP21237 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BdnfP21237 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BdnfP21237 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BdnfP21237 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BdnfP21237 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BdnfP21237 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BdnfP21237 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BdnfP21237 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BdnfP21237 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BdnfP21237 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BdnfP21237 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206 ms