Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P20040 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P20040 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P20040 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P20040 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P20040 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P20040 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P20040 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P20040 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P20040 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P20040 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P20040 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P20040 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P20040 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P20040 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P20040 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P20040 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P20040 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P20040 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P20040 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
P20040 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
P20040 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P20040 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P20040 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P20040 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P20040 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P20040 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P20040 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P20040 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P20040 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P20040 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P20040 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P20040 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P20040 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P20040 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P20040 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
P20040 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P20040 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P20040 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P20040 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P20040 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P20040 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P20040 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P20040 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P20040 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P20040 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P20040 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P20040 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P20040 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P20040 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P20040 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P20040 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P20040 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P20040 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P20040 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P20040 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P20040 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P20040 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P20040 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P20040 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P20040 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P20040 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P20040 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P20040 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P20040 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P20040 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P20040 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P20040 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P20040 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P20040 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P20040 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P20040 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P20040 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P20040 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P20040 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P20040 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P20040 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P20040 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P20040 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P20040 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P20040 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
P20040 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P20040 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P20040 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P20040 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P20040 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P20040 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P20040 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P20040 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P20040 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P20040 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P20040 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P20040 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P20040 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P20040 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P20040 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P20040 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P20040 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
P20040 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P20040 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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