Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trap1aP19473 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Trap1aP19473 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trap1aP19473 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Trap1aP19473 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trap1aP19473 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trap1aP19473 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trap1aP19473 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trap1aP19473 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trap1aP19473 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trap1aP19473 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Trap1aP19473 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trap1aP19473 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trap1aP19473 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Trap1aP19473 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trap1aP19473 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trap1aP19473 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trap1aP19473 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trap1aP19473 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Trap1aP19473 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trap1aP19473 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trap1aP19473 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Trap1aP19473 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trap1aP19473 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trap1aP19473 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trap1aP19473 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trap1aP19473 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trap1aP19473 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms