Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RargP18911 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RargP18911 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RargP18911 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RargP18911 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RargP18911 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RargP18911 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RargP18911 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RargP18911 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RargP18911 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RargP18911 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RargP18911 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RargP18911 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RargP18911 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RargP18911 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RargP18911 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RargP18911 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RargP18911 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RargP18911 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RargP18911 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RargP18911 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RargP18911 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RargP18911 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RargP18911 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RargP18911 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RargP18911 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RargP18911 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RargP18911 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RargP18911 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RargP18911 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RargP18911 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RargP18911 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RargP18911 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RargP18911 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RargP18911 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RargP18911 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RargP18911 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RargP18911 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RargP18911 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RargP18911 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RargP18911 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RargP18911 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RargP18911 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RargP18911 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RargP18911 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RargP18911 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RargP18911 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RargP18911 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RargP18911 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RargP18911 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RargP18911 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RargP18911 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RargP18911 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RargP18911 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RargP18911 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RargP18911 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RargP18911 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RargP18911 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RargP18911 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RargP18911 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RargP18911 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RargP18911 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RargP18911 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RargP18911 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RargP18911 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RargP18911 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RargP18911 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RargP18911 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RargP18911 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RargP18911 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RargP18911 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RargP18911 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RargP18911 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RargP18911 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RargP18911 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RargP18911 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RargP18911 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RargP18911 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RargP18911 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RargP18911 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RargP18911 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RargP18911 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RargP18911 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RargP18911 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RargP18911 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RargP18911 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RargP18911 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RargP18911 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RargP18911 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RargP18911 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RargP18911 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RargP18911 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RargP18911 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RargP18911 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RargP18911 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RargP18911 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RargP18911 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RargP18911 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RargP18911 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RargP18911 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms