Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme1P15532 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme1P15532 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme1P15532 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme1P15532 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme1P15532 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme1P15532 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme1P15532 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nme1P15532 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme1P15532 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme1P15532 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme1P15532 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme1P15532 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme1P15532 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme1P15532 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme1P15532 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme1P15532 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme1P15532 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme1P15532 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme1P15532 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nme1P15532 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme1P15532 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nme1P15532 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme1P15532 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme1P15532 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme1P15532 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme1P15532 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme1P15532 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme1P15532 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme1P15532 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms