Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrm1P12657 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrm1P12657 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrm1P12657 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Chrm1P12657 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrm1P12657 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chrm1P12657 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chrm1P12657 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms