Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gap43P06837 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gap43P06837 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gap43P06837 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gap43P06837 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gap43P06837 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gap43P06837 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gap43P06837 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gap43P06837 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gap43P06837 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gap43P06837 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gap43P06837 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gap43P06837 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gap43P06837 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gap43P06837 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gap43P06837 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gap43P06837 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gap43P06837 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gap43P06837 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gap43P06837 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gap43P06837 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gap43P06837 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gap43P06837 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gap43P06837 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gap43P06837 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gap43P06837 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gap43P06837 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gap43P06837 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gap43P06837 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gap43P06837 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gap43P06837 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gap43P06837 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gap43P06837 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gap43P06837 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gap43P06837 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gap43P06837 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gap43P06837 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gap43P06837 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gap43P06837 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gap43P06837 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gap43P06837 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gap43P06837 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gap43P06837 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gap43P06837 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gap43P06837 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms