Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P06683 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P06683 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P06683 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P06683 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P06683 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P06683 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P06683 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P06683 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P06683 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P06683 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9P06683 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P06683 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P06683 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P06683 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P06683 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9P06683 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P06683 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P06683 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9P06683 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P06683 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9P06683 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9P06683 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9P06683 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P06683 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P06683 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P06683 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9P06683 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9P06683 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9P06683 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P06683 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P06683 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P06683 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P06683 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P06683 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P06683 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P06683 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P06683 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P06683 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P06683 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P06683 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P06683 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P06683 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P06683 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9P06683 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P06683 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P06683 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P06683 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P06683 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P06683 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P06683 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P06683 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P06683 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P06683 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9P06683 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9P06683 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9P06683 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P06683 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P06683 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P06683 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P06683 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P06683 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P06683 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P06683 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P06683 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9P06683 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9P06683 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9P06683 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9P06683 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P06683 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P06683 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P06683 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P06683 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9P06683 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9P06683 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9P06683 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9P06683 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9P06683 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9P06683 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9P06683 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9P06683 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9P06683 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9P06683 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9P06683 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9P06683 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9P06683 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9P06683 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9P06683 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9P06683 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9P06683 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9P06683 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9P06683 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9P06683 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9P06683 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9P06683 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9P06683 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9P06683 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9P06683 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9P06683 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9P06683 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms