Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06320 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06320 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06320 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06320 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06320 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06320 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06320 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06320 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06320 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06320 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06320 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06320 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06320 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06320 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06320 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06320 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06320 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P06320 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06320 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06320 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06320 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06320 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06320 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06320 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06320 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06320 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06320 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06320 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06320 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06320 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06320 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06320 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06320 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06320 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06320 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06320 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06320 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06320 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06320 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06320 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06320 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06320 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06320 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06320 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06320 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06320 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06320 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06320 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06320 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06320 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06320 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06320 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06320 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06320 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06320 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06320 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06320 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06320 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06320 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06320 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06320 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06320 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06320 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06320 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06320 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06320 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06320 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06320 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06320 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06320 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06320 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06320 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06320 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06320 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06320 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06320 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06320 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06320 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06320 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06320 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06320 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06320 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06320 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06320 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06320 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06320 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06320 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06320 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06320 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06320 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P06320 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06320 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06320 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06320 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06320 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06320 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06320 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06320 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06320 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms