Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01821 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01821 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01821 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01821 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01821 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01821 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01821 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01821 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01821 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01821 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01821 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01821 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01821 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01821 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01821 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01821 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01821 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01821 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01821 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01821 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01821 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01821 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01821 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01821 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01821 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01821 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01821 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01821 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01821 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01821 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01821 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01821 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01821 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01821 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01821 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01821 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01821 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01821 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01821 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01821 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01821 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01821 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01821 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01821 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01821 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01821 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01821 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01821 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01821 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01821 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01821 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01821 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01821 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01821 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01821 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01821 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01821 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01821 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01821 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01821 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01821 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01821 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01821 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01821 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01821 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01821 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01821 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01821 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01821 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01821 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01821 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01821 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01821 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01821 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01821 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01821 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01821 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01821 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01821 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01821 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01821 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01821 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01821 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01821 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01821 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01821 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01821 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01821 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01821 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01821 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01821 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01821 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01821 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01821 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01821 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01821 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01821 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01821 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01821 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms