Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01757 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01757 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01757 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01757 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01757 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01757 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01757 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01757 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01757 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01757 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01757 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01757 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01757 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01757 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01757 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01757 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01757 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01757 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01757 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01757 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01757 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01757 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01757 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01757 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01757 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01757 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01757 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01757 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01757 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01757 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01757 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01757 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01757 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01757 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01757 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01757 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01757 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01757 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01757 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01757 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01757 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01757 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01757 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01757 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01757 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01757 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01757 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01757 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01757 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01757 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01757 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01757 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01757 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01757 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01757 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01757 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01757 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01757 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01757 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01757 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01757 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01757 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01757 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01757 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01757 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01757 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01757 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01757 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01757 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01757 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01757 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01757 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01757 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01757 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01757 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01757 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01757 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01757 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01757 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01757 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01757 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01757 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01757 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01757 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01757 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01757 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01757 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01757 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01757 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01757 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01757 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01757 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01757 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01757 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01757 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01757 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01757 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01757 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01757 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms