Protein–RNA interactions for Protein: P01587

Csf2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2P01587 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2P01587 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2P01587 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csf2P01587 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csf2P01587 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf2P01587 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf2P01587 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2P01587 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2P01587 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2P01587 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2P01587 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2P01587 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2P01587 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2P01587 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2P01587 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2P01587 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2P01587 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2P01587 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2P01587 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf2P01587 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Csf2P01587 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csf2P01587 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2P01587 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2P01587 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2P01587 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms