Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capns1O88456 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capns1O88456 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capns1O88456 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capns1O88456 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns1O88456 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Capns1O88456 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capns1O88456 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Capns1O88456 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capns1O88456 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capns1O88456 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capns1O88456 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capns1O88456 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capns1O88456 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capns1O88456 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capns1O88456 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns1O88456 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capns1O88456 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capns1O88456 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capns1O88456 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capns1O88456 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capns1O88456 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns1O88456 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capns1O88456 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns1O88456 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns1O88456 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capns1O88456 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capns1O88456 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms